MacBookPro、iPad、iPhoneで使用しているSafari のブックマークを削除してもゾンビのように復活する事象があるようです。
以下は質問の抜粋です。
Safari を使用して、ブックマークを編集し、ブックマークの一部を削除し、ブックマークのあるフォルダーをいくつか削除しましたが、ブックマークは「ゾンビ」のように戻ってきます。
私はMacBookPro、iPad、iPhoneにiCloudを入れています。すべてのデバイス上の同じブックマークを 1 つずつ削除する必要がありますか?
ブックマークを完全に削除するにはどうすればよいですか?
以下は回答の抜粋です。
保持したい最新のブックマーク セットがあるデバイス/コンピューターを選択します。そのデバイス/コンピューターで、「設定」/「あなたの名前」/「iCloud」または「システム環境設定」/「iCloud」で Safari iCloud 同期を停止します。他のデバイス/コンピュータでは、すべてのブックマークを削除します。同期するまでしばらくお待ちください。次に、Safari の同期をオフにしたところからオンにします。
「情報元」
Safari Bookmarks won't stay deleted ("zom… - Apple Community
マルチデバイスだと発生しそうですね。